Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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