Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930579F01RikE9Q3L6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms