Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms