Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc175E9PVB3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms