Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms