Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms