Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms