Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6133B2RY53 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6133B2RY53 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6133B2RY53 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6133B2RY53 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6133B2RY53 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6133B2RY53 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6133B2RY53 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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