Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cspp1B2RX88 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cspp1B2RX88 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.7 ms