Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Clrn2B2RVW2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clrn2B2RVW2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms