Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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