Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr16A3KMN5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms