Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Atp8b5A3FIN4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Atp8b5A3FIN4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Atp8b5A3FIN4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp8b5A3FIN4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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