Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ism1A2ATD1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms