Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Syndig1A2ANU3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syndig1A2ANU3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms