Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc183A2AJB1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms