Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ambra1A2AH22 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms