Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ckap5A2AGT5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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