Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm16A2A935 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Prdm16A2A935 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Prdm16A2A935 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Prdm16A2A935 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm16A2A935 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms