Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms