Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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