Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac6Q9Z2V5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms