Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Crlf3Q9Z2L7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Crlf3Q9Z2L7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Crlf3Q9Z2L7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Crlf3Q9Z2L7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Crlf3Q9Z2L7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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