Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptgdr2Q9Z2J6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms