Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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