Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Cldn13Q9Z0S4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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