Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

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Length 801 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdh20Q9Z0M3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdh20Q9Z0M3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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