Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vax2Q9WTP9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms