Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Plod1Q9R0E2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms