Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms