Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms