Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snai3Q9QY31 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms