Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Kcnip3Q9QXT8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms