Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf3Q9QXK7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms