Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms