Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dclk1Q9JLM8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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