Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Habp4Q9JKS5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Habp4Q9JKS5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Habp4Q9JKS5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Habp4Q9JKS5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Habp4Q9JKS5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms