Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ybx3Q9JKB3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms