Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Zfhx4Q9JJN2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfhx4Q9JJN2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms