Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rb1cc1Q9ESK9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms