Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn12Q9ER56 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms