Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpcn1Q9EQJ0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms