Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tlr1Q9EPQ1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tlr1Q9EPQ1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tlr1Q9EPQ1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tlr1Q9EPQ1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tlr1Q9EPQ1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tlr1Q9EPQ1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tlr1Q9EPQ1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tlr1Q9EPQ1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tlr1Q9EPQ1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tlr1Q9EPQ1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tlr1Q9EPQ1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr1Q9EPQ1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms