Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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