Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg8Q9DBM0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms