Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrpraQ9DBG7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms