Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenooQ9DBC0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms