Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smdt1Q9DB10 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms