Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smco2Q9DA21 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco2Q9DA21 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms