Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms